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L’IA open source au service de la recherche médicale

Aujourd’hui, plusieurs initiatives d’intelligence artificielle open source sont dédiées à la recherche médicale, et certaines d’entre elles se distinguent par leur impact et leur pertinence. Voici quelques exemples :

1. BioGPT

  • Description : BioGPT, développé par Microsoft Research, est un modèle de langage pré-entraîné spécifiquement sur des données biomédicales. Il est open source et conçu pour aider à la rédaction d’articles scientifiques, à l’extraction de connaissances et à la génération d’hypothèses dans le domaine médical.
  • Domaines d’application : Génération de textes biomédicaux, aide à la recherche, traitement de données scientifiques complexes.
  • Lien : Microsoft BioGPT sur GitHub

2. MONAI (Medical Open Network for AI)

  • Description : MONAI, soutenu par NVIDIA et King’s College London, est une bibliothèque d’outils open source spécifiquement conçue pour l’analyse d’images médicales. Elle s’appuie sur des frameworks comme PyTorch et est adaptée pour des tâches comme la segmentation, la classification et la reconstruction d’images médicales.
  • Domaines d’application : Radiologie, IRM, tomodensitométrie, analyses pathologiques.
  • Lien : MONAI sur GitHub

3. DeepChem

  • Description : DeepChem est une bibliothèque d’IA open source pour la chimie computationnelle et la découverte de médicaments. Elle fournit des outils pour modéliser les interactions moléculaires, analyser des structures chimiques et développer des médicaments.
  • Domaines d’application : Découverte de médicaments, prédiction de propriétés chimiques et biologiques.
  • Lien : DeepChem sur GitHub

4. Apache cTAKES (clinical Text Analysis and Knowledge Extraction System)

  • Description : cTAKES est un système open source de traitement du langage naturel développé pour analyser des textes cliniques. Il extrait des informations médicales, comme des diagnostics ou des prescriptions, à partir de dossiers médicaux électroniques (DME).
  • Domaines d’application : Extraction d’informations cliniques, aide au diagnostic.
  • Lien : Apache cTAKES

5. OpenClinica

  • Description : OpenClinica est une plateforme open source pour la gestion des essais cliniques. Elle est utilisée pour la collecte et l’analyse de données cliniques dans des environnements réglementés.
  • Domaines d’application : Gestion des essais cliniques, collecte de données, conformité réglementaire.
  • Lien : OpenClinica

Pourquoi ces solutions sont pertinentes ?

  • Accessibilité : Elles permettent aux chercheurs, institutions et hôpitaux de disposer d’outils puissants sans coûts prohibitifs.
  • Personnalisation : Le code source étant ouvert, il peut être adapté à des besoins spécifiques.
  • Communauté : Elles bénéficient de contributions régulières d’une large communauté internationale, garantissant des mises à jour et une robustesse accrue.